Turun tiedepuisto sijaitsee hyvien kulkuyhteyksien varrella lähellä Turun keskustaa. Lentokentälle on matkaa 8 km ja satamaan 5 km. Kupittaan rautatieasema palvelee junamatkustajia vain 500 metrin päässä. Kaupunkilikenne Fölin linjat 6, 60, 32, 42 ja työmatkalinja 58 kulkevat tiedepuistoon.

Myös autoilijoiden on helppo saapua Turun tiedepuistoon: Helsingin valtatie kulkee aivan alueen vierestä, ja pysäköintitiloja on alueella runsaasti.